RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598934.5

LINC00854-210, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 337 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-210	ENST00000598934	NLRP3	Q96P20	1036 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	PTGIR	P43119	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NNT	Q13423	1086 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	AXIN1	O15169	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	MARCH6	O60337	910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	PHACTR2	O75167	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	HSD3B2	P26439	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	HPS1	Q92902	700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	CLSTN1	O94985	981 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	TIMP2	P16035	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	IDH3A	P50213	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	IGBP1	P78318	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	SERINC3	Q13530	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	KCNB2	Q92953	911 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ETFB	P38117	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	RELB	Q01201	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934		Q6ZVU0	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	MKL1	Q969V6	931 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00854-210	ENST00000598934	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934		F6X3S4	739 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	INPP5B	P32019	993 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	ARSD	P51689	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	HIF1A	Q16665	826 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	IER5	Q5VY09	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC00854-210	ENST00000598934	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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