RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ECE1P42892 770 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 GRAPQ13588 217 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT24Q2M2I5 525 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 MPNDQ8N594 471 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPNS2Q96L46 248 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 NEUROD2Q15784 382 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 CIAPIN1Q6FI81 312 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 CHPF2Q9P2E5 772 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 TMC4Q7Z404 712 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-226ENST00000593200 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 YDJCA8MPS7 323 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 RAD17O75943 681 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXB7P09629 217 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 TNIP1Q15025 636 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 PLBD2Q8NHP8 589 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 RUNDC1Q96C34 613 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 GRM1Q13255 1194 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 SAPCD2Q86UD0 394 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF428Q96B54 188 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ISCA1Q9BUE6 129 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP2K2P36507 400 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 HHIPL1Q96JK4 782 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 COL4A1P02462 1669 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 AOC2O75106 756 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM89AQ96GI7 184 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ABHD8Q96I13 439 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 SHTN1A0MZ66 631 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 WASHC4Q2M389 1173 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC37L1Q7L3B6 337 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 MICALL2Q8IY33 904 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 DPF2Q92785 391 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP44Q96MT7 982 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 HYPKQ9NX55 129 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 H7C1D1 291 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMD14O00487 310 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 POLLQ9UGP5 575 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-226ENST00000593200 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GPSM2P81274 684 aa13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 MBIPQ9NS73 344 aa13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TSKSQ9UJT2 592 aa13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 C6orf229H3BNL8 230 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RIMBP2O15034 1052 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 CA12O43570 354 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SAMD7Q7Z3H4 446 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 EYA3Q99504 573 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SCN9AQ15858 1988 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RTL9Q8NET4 1388 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ECE2O60344 883 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 EGFRP00533 1210 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF853P0CG23 659 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS8P62241 208 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 USP48Q86UV5 1035 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D16Q8TBP0 767 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA2Q08379 1002 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 DOK7Q18PE1 504 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 DLK2Q6UY11 383 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms