RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
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MBD3-211ENST00000592965 EPHX2P34913 555 aa30.04■■■□□ 2.4
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MBD3-211ENST00000592965 CACNA1FO60840 1977 aa29.97■■■□□ 2.39
MBD3-211ENST00000592965 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
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MBD3-211ENST00000592965 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.94■■■□□ 2.38
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MBD3-211ENST00000592965 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.93■■■□□ 2.38
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MBD3-211ENST00000592965 RIMBP2O15034 1052 aa29.78■■■□□ 2.36
MBD3-211ENST00000592965 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
MBD3-211ENST00000592965 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
MBD3-211ENST00000592965 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29.77■■■□□ 2.36
MBD3-211ENST00000592965 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.77■■■□□ 2.36
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