RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANAPC15	P60006	121 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	PXDN	Q92626	1479 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-222	ENST00000592408	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATF3	P18847	181 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	GFRA3	O60609	400 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	MRE11	P49959	708 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	ORAI2	Q96SN7	254 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADCY9	O60503	1353 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	FSD2	A1L4K1	749 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZPR1	O75312	459 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	DNAJB2	P25686	324 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	MTX1	Q13505	466 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	MRC1	P22897	1456 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHML	P26374	656 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	TLL1	O43897	1013 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC10A3	P09131	477 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-222	ENST00000592408	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	SSFA2	P28290	1259 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	FBXO41	Q8TF61	875 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms