RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 GRAPQ13588 217 aa35.89■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.89■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 GLTPD2A6NH11 291 aa35.88■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 PDE8AO60658 829 aa35.88■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 CDHR2Q9BYE9 1310 aa35.87■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 GCKRQ14397 625 aa35.87■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa35.87■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 SLC51AQ86UW1 340 aa35.86■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 H7C1W4 665 aa35.85■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 GRIPAP1Q4V328 841 aa35.85■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 BCL2L13Q9BXK5 485 aa35.85■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa35.85■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 CACNA1FO60840 1977 aa35.84■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 HTRA3P83110 453 aa35.84■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.84■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 BEND3Q5T5X7 828 aa35.84■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa35.84■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 SP8Q8IXZ3 490 aa35.83■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 SMC1BQ8NDV3 1235 aa35.83■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 PSMD1Q99460 953 aa35.83■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 SNED1Q8TER0 1413 aa35.83■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 LAMB2P55268 1798 aa35.82■■■■□ 3.33
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC152Q4G0S7 254 aa35.82■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 WDR90Q96KV7 1748 aa35.82■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 SLC4A10Q6U841 1118 aa35.81■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 SMC4Q9NTJ3 1288 aa35.81■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 TMC4Q7Z404 712 aa35.8■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 CTSWP56202 376 aa35.79■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 PTPRCP08575 1304 aa35.79■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 IARSP41252 1262 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 KLRG1Q96E93 195 aa35.78■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 SEC31BQ9NQW1 1179 aa35.78■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 CASP7P55210 303 aa35.77■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 RPS8P62241 208 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 DPY19L2Q6NUT2 758 aa35.76■■■■□ 3.32
NOMO3-217ENST00000576589 MPNDQ8N594 471 aa35.75■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 TTLL11Q8NHH1 800 aa35.75■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa35.75■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 TIAM2Q8IVF5 1701 aa35.74■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 ALDH1L1O75891 902 aa35.74■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 PLA2G12BQ9BX93 195 aa35.74■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa35.73■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 POTECB2RU33 542 aa35.72■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 ZBED9Q6R2W3 1325 aa35.72■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 RARSP54136 660 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 SUPT20HQ8NEM7 779 aa35.71■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 GRM8O00222 908 aa35.7■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 JMYQ8N9B5 988 aa35.7■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 GREM2Q9H772 168 aa35.7■■■■□ 3.31
NOMO3-217ENST00000576589 JDP2Q8WYK2 163 aa35.69■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
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NOMO3-217ENST00000576589 LARGE2Q8N3Y3 721 aa35.68■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 COL4A1P02462 1669 aa35.67■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 RTL9Q8NET4 1388 aa35.66■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 PPIP5K2O43314 1243 aa35.66■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 TAF1P21675 1872 aa35.65■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 CSF1RP07333 972 aa35.65■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 VPS33BQ9H267 617 aa35.65■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 GPSM2P81274 684 aa35.64■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 AOC3Q16853 763 aa35.64■■■■□ 3.3
NOMO3-217ENST00000576589 FZD9O00144 591 aa35.63■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 DDNO94850 711 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 FOXO4P98177 505 aa35.62■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 FAM161AQ3B820 660 aa35.62■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 NIM1KQ8IY84 436 aa35.62■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
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NOMO3-217ENST00000576589 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF541Q9H0D2 1346 aa35.6■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 C6orf229H3BNL8 230 aa35.59■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 KIAA2012Q0VF49 1180 aa35.59■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 EPHA10Q5JZY3 1008 aa35.59■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 CHMP3Q9Y3E7 222 aa35.59■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 KIF16BQ96L93 1317 aa35.58■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 EIF6P56537 245 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa35.58■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 POLLQ9UGP5 575 aa35.58■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 COL4A5P29400 1685 aa35.58■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 UTYO14607 1347 aa35.57■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 LRRC37AA6NMS7 1700 aa35.57■■■■□ 3.29
NOMO3-217ENST00000576589 LMBR1LQ6UX01 489 aa35.57■■■■□ 3.28
NOMO3-217ENST00000576589 PODXL2Q9NZ53 605 aa35.57■■■■□ 3.28
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