RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLX4Q8IY92 1834 aa41.76■■■■■ 4.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 USP44Q9H0E7 712 aa41.75■■■■■ 4.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM57Q8N5G2 664 aa41.7■■■■■ 4.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC31BQ9NQW1 1179 aa41.62■■■■■ 4.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ITPRIPQ8IWB1 547 aa41.6■■■■■ 4.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM161AQ3B820 660 aa41.59■■■■■ 4.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MINPP1Q9UNW1 487 aa41.36■■■■■ 4.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 LMNB1P20700 586 aa41.35■■■■■ 4.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa41.35■■■■■ 4.21
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