RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568810.5

PPP4C-213, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,080 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-213	ENST00000568810	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	COL4A5	P29400	1685 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	GPC2	Q8N158	579 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	MPND	Q8N594	471 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	TAF1	P21675	1872 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	PPIP5K2	O43314	1243 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	NIM1K	Q8IY84	436 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	HACL1	Q9UJ83	578 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP4C-213	ENST00000568810	AOC3	Q16853	763 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	VAMP4	O75379	141 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	CHADL	Q6NUI6	762 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	G2E3	Q7L622	706 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	PDE8A	O60658	829 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	POTEI	P0CG38	1075 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	POTEJ	P0CG39	1038 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	FLII	Q13045	1269 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	LDHD	Q86WU2	507 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	EPHX2	P34913	555 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-213	ENST00000568810	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	HTRA3	P83110	453 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	COL4A1	P02462	1669 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	SCNN1D	P51172	638 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	CTSW	P56202	376 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	CXCL9	Q07325	125 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	KLRG1	Q96E93	195 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PPP4C-213	ENST00000568810	GPSM2	P81274	684 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	WASHC4	Q2M389	1173 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	LTBP1	Q14766	1721 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810		H7C1W4	665 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	MYH3	P11055	1940 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	C6orf229	H3BNL8	230 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	GCKR	Q14397	625 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	EYA3	Q99504	573 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	TNIP1	Q15025	636 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	EPS15	P42566	896 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	PASK	Q96RG2	1323 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	RTL9	Q8NET4	1388 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PPP4C-213	ENST00000568810	RAD17	O75943	681 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	CREBZF	Q9NS37	354 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	YDJC	A8MPS7	323 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	JMY	Q8N9B5	988 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	GREM2	Q9H772	168 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810		E9PSI1	815 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	CCER2	I3L3R5	266 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP4C-213	ENST00000568810	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.6	■■■□□ 2.65

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