RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.28■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 BBOX1O75936 387 aa20.27■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 LBX1P52954 281 aa20.27■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 SP8Q8IXZ3 490 aa20.27■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 MPNDQ8N594 471 aa20.27■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.27■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 RUNDC1Q96C34 613 aa20.27■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NME3-211ENST00000568561 RAD17O75943 681 aa20.26■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 GRAPQ13588 217 aa20.26■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.26■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.25■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.25■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 CST9Q5W186 159 aa20.25■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.24■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.24■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 FAM89AQ96GI7 184 aa20.24■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 CAPNS2Q96L46 248 aa20.24■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 VPS33BQ9H267 617 aa20.24■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.24■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 SHTN1A0MZ66 631 aa20.23■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 YDJCA8MPS7 323 aa20.23■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.23■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.23■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.22■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.22■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.21■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
NME3-211ENST00000568561 HOXB7P09629 217 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 MBIPQ9NS73 344 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.2■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 TNIP1Q15025 636 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 CFAP44Q96MT7 982 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.19■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 RIMBP2O15034 1052 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 AOC2O75106 756 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 ECE1P42892 770 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 TMC4Q7Z404 712 aa20.18■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 SCN9AQ15858 1988 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 GPSM2P81274 684 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 MICALL2Q8IY33 904 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 HYPKQ9NX55 129 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 TSKSQ9UJT2 592 aa20.17■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 C6orf229H3BNL8 230 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 WASHC4Q2M389 1173 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 DLK2Q6UY11 383 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 POLLQ9UGP5 575 aa20.16■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 PSMD14O00487 310 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.15■□□□□ 0.82
NME3-211ENST00000568561 APAF1O14727 1248 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 EGFRP00533 1210 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 ZNF853P0CG23 659 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 DOK7Q18PE1 504 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.14■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 RTL9Q8NET4 1388 aa20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 H7C1D1 291 aa20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 ECE2O60344 883 aa20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 GOLGA2Q08379 1002 aa20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 USP48Q86UV5 1035 aa20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 MYD88Q99836 296 aa20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 SPEF2Q9C093 1822 aa20.13■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 ABHD8Q96I13 439 aa20.12■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms