RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 SEC24BO95487 1268 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 GREM2Q9H772 168 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 MSH5O43196 834 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 TFCP2Q12800 502 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 AACSQ86V21 672 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 SETDB2Q96T68 719 aa23.15■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 EYA2O00167 538 aa23.14■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 ITGA6P23229 1130 aa23.14■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 LRRC24Q50LG9 513 aa23.14■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 SDSP20132 328 aa23.14■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 SSFA2P28290 1259 aa23.14■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 AOX1Q06278 1338 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 ERFEQ4G0M1 354 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.12■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 CIAO1O76071 339 aa23.12■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 ZNF827Q17R98 1081 aa23.11■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.11■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 LAMB2P55268 1798 aa23.11■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 TNNI3KQ59H18 835 aa23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 NYXQ9GZU5 481 aa23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.1■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 CDC45O75419 566 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 AKT1S1Q96B36 256 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 FBXO3Q9UK99 471 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 GYS1P13807 737 aa23.08■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 GPATCH3Q96I76 525 aa23.08■■□□□ 1.29
INO80E-211ENST00000567987 NFIXQ14938 502 aa23.08■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.08■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.08■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 ABCC12Q96J65 1359 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 ERC2O15083 957 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 RILPL2Q969X0 211 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 GPR108Q9NPR9 543 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 RTL9Q8NET4 1388 aa23.04■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 TIMM10P62072 90 aa23.04■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.04■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.04■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.03■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 NPHP1O15259 732 aa23.02■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.02■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 CASZ1Q86V15 1759 aa23.02■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 METTL24Q5JXM2 366 aa23.02■■□□□ 1.28
INO80E-211ENST00000567987 ZNF609O15014 1411 aa23.01■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.01■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 A0A1B0GUL7 405 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 TM4SF1P30408 202 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 NLRP3Q96P20 1036 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 LRP5O75197 1615 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 CASC1Q6TDU7 716 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 CNBD1Q8NA66 436 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 MPHOSPH8Q99549 860 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 AK9Q5TCS8 1911 aa22.99■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 CNTROBQ8N137 903 aa22.99■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.99■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
INO80E-211ENST00000567987 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms