RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	HTRA3	P83110	453 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	AOC3	Q16853	763 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	CHADL	Q6NUI6	762 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	KSR2	Q6VAB6	950 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	NIM1K	Q8IY84	436 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNA1S	Q13698	1873 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR90	Q96KV7	1748 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	POTEI	P0CG38	1075 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	POTEJ	P0CG39	1038 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP350	Q5VT06	3117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE8A	O60658	829 aa		12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	VAMP4	O75379	141 aa		12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	EPHX2	P34913	555 aa		12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	LDHD	Q86WU2	507 aa		12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		12.05	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		12.04	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		12.04	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	G2E3	Q7L622	706 aa		12.04	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	KLRG1	Q96E93	195 aa		12.04	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV5-2	P06315	115 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		12.02	□□□□□ -0.48
KIFC3-231	ENST00000567479	C6orf229	H3BNL8	230 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	GPSM2	P81274	684 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CXCL9	Q07325	125 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	FLII	Q13045	1269 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	TNIP1	Q15025	636 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	WASHC4	Q2M389	1173 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	EPS15	P42566	896 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	SCNN1D	P51172	638 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CNTROB	Q8N137	903 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	EYA3	Q99504	573 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	POLL	Q9UGP5	575 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	COL4A5	P29400	1685 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479		H7C1W4	665 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	RIMBP2	O15034	1052 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	RAD17	O75943	681 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CTSW	P56202	376 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CREBZF	Q9NS37	354 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		12	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	GCKR	Q14397	625 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	PASK	Q96RG2	1323 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479		G3V3G9	751 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	SCN4A	P35499	1836 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	UFL1	O94874	794 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	GREM2	Q9H772	168 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	LAMB2	P55268	1798 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms