RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567432.1

GINS3-208, Transcript of GINS complex subunit 3, human

TSL 3

Gene GINS3, Length 322 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GINS3-208	ENST00000567432	GPR182	O15218	404 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TREH	O43280	583 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	NEFL	P07196	543 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	RARA	P10276	462 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ARAF	P10398	606 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ERCC3	P19447	782 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	GMPR	P36959	345 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	MAP2K3	P46734	347 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	KRT76	Q01546	638 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	MMP20	O60882	483 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	SIN3B	O75182	1162 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ADH6	P28332	368 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	DSC3	Q14574	896 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	PHACTR2	O75167	634 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	PSAP	P07602	524 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	SLURP2	P0DP57	97 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	CES1	P23141	567 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	SOX18	P35713	384 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	PLAUR	Q03405	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ORC1	Q13415	861 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ACD	Q96AP0	544 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	GGA1	Q9UJY5	639 aa		4.14	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	EREG	O14944	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	MAPK8	P45983	427 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	NRL	P54845	237 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	GPLD1	P80108	840 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	HYAL2	Q12891	473 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	PCSK7	Q16549	785 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	KIF4A	O95239	1232 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	BCR	P11274	1271 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ADH7	P40394	386 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	SIK1	P57059	783 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GINS3-208	ENST00000567432	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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