RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 ZNF827Q17R98 1081 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 GREM2Q9H772 168 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 SSFA2P28290 1259 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 ERFEQ4G0M1 354 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 LRRC24Q50LG9 513 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 TFCP2Q12800 502 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 SETDB2Q96T68 719 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 ABCC12Q96J65 1359 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 ITGA6P23229 1130 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 AACSQ86V21 672 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 STAP2Q9UGK3 403 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 AKT1S1Q96B36 256 aa21.75■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 LRP5O75197 1615 aa21.75■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 EYA2O00167 538 aa21.74■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 SEC24BO95487 1268 aa21.74■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.74■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 GYS1P13807 737 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 SPEF2Q9C093 1822 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.73■■□□□ 1.07
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HERC2-208ENST00000566635 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 NFIXQ14938 502 aa21.73■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 COL4A1P02462 1669 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 AOX1Q06278 1338 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 CIAO1O76071 339 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.72■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 SDSP20132 328 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 TNNI3KQ59H18 835 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 NYXQ9GZU5 481 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HERC2-208ENST00000566635 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.7■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 ZNF609O15014 1411 aa21.69■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.69■■□□□ 1.06
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HERC2-208ENST00000566635 RTL9Q8NET4 1388 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.68■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.68■■□□□ 1.06
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HERC2-208ENST00000566635 TAF1P21675 1872 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 CDC45O75419 566 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 AK9Q5TCS8 1911 aa21.67■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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HERC2-208ENST00000566635 MSH5O43196 834 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.66■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 NPHP1O15259 732 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.65■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 DDR1Q08345 913 aa21.64■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 CNBD1Q8NA66 436 aa21.64■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 RILPL2Q969X0 211 aa21.64■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 GPR108Q9NPR9 543 aa21.64■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.64■■□□□ 1.06
HERC2-208ENST00000566635 TM4SF1P30408 202 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 METTL24Q5JXM2 366 aa21.64■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 ERC2O15083 957 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 TIMM10P62072 90 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.63■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 A0A1B0GUL7 405 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 BAG6P46379 1132 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.62■■□□□ 1.05
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