RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
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CMTM4-204ENST00000563952 TOMM70O94826 608 aa39.28■■■■□ 3.88
CMTM4-204ENST00000563952 SP8Q8IXZ3 490 aa39.27■■■■□ 3.88
CMTM4-204ENST00000563952 NEURL1BA8MQ27 555 aa39.26■■■■□ 3.88
CMTM4-204ENST00000563952 MIER1Q8N108 512 aa39.26■■■■□ 3.88
CMTM4-204ENST00000563952 DNAAF4Q8WXU2 420 aa39.26■■■■□ 3.88
CMTM4-204ENST00000563952 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 PDE8AO60658 829 aa39.24■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 DDNO94850 711 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 WDR90Q96KV7 1748 aa39.23■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 SLFN5Q08AF3 891 aa39.23■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 JDP2Q8WYK2 163 aa39.23■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 CDHR2Q9BYE9 1310 aa39.22■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 TMC4Q7Z404 712 aa39.22■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF541Q9H0D2 1346 aa39.21■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 LARGE2Q8N3Y3 721 aa39.21■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 MPNDQ8N594 471 aa39.21■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 CDCA7LQ96GN5 454 aa39.21■■■■□ 3.87
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
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CMTM4-204ENST00000563952 COL4A5P29400 1685 aa39.19■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 F6X3S4 739 aa39.19■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC152Q4G0S7 254 aa39.19■■■■□ 3.86
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CMTM4-204ENST00000563952 LINS1Q8NG48 757 aa39.18■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 SEC31BQ9NQW1 1179 aa39.18■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC37AA6NMS7 1700 aa39.17■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 POTECB2RU33 542 aa39.17■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 PPIP5K2O43314 1243 aa39.17■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 GCKRQ14397 625 aa39.17■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 FZD9O00144 591 aa39.16■■■■□ 3.86
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CMTM4-204ENST00000563952 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 H7C1W4 665 aa39.14■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 CTSWP56202 376 aa39.14■■■■□ 3.86
CMTM4-204ENST00000563952 NIM1KQ8IY84 436 aa39.14■■■■□ 3.86
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CMTM4-204ENST00000563952 VPS33BQ9H267 617 aa39.11■■■■□ 3.85
CMTM4-204ENST00000563952 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
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CMTM4-204ENST00000563952 BEND3Q5T5X7 828 aa39.09■■■■□ 3.85
CMTM4-204ENST00000563952 TTLL11Q8NHH1 800 aa39.09■■■■□ 3.85
CMTM4-204ENST00000563952 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
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CMTM4-204ENST00000563952 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
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CMTM4-204ENST00000563952 SLC4A10Q6U841 1118 aa39.07■■■■□ 3.85
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CMTM4-204ENST00000563952 SMC1BQ8NDV3 1235 aa39.07■■■■□ 3.85
CMTM4-204ENST00000563952 GJA3Q9Y6H8 435 aa39.07■■■■□ 3.85
CMTM4-204ENST00000563952 IQCA1LA6NCM1 817 aa39.06■■■■□ 3.84
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CMTM4-204ENST00000563952 CASP7P55210 303 aa39.05■■■■□ 3.84
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA2012Q0VF49 1180 aa39.05■■■■□ 3.84
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CMTM4-204ENST00000563952 SCN4AP35499 1836 aa39.05■■■■□ 3.84
CMTM4-204ENST00000563952 C6orf229H3BNL8 230 aa39.04■■■■□ 3.84
CMTM4-204ENST00000563952 BCL2L13Q9BXK5 485 aa39.04■■■■□ 3.84
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CMTM4-204ENST00000563952 SPEF2Q9C093 1822 aa39.01■■■■□ 3.84
CMTM4-204ENST00000563952 LTBP1Q14766 1721 aa39.01■■■■□ 3.84
CMTM4-204ENST00000563952 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa39.01■■■■□ 3.84
CMTM4-204ENST00000563952 HACL1Q9UJ83 578 aa39.01■■■■□ 3.84
CMTM4-204ENST00000563952 RTL9Q8NET4 1388 aa39■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 WASHC4Q2M389 1173 aa39■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 RIMBP2O15034 1052 aa38.99■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa38.99■■■■□ 3.83
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CMTM4-204ENST00000563952 ALDH1L1O75891 902 aa38.97■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 ALDH1L2Q3SY69 923 aa38.97■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
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CMTM4-204ENST00000563952 POTEIP0CG38 1075 aa38.96■■■■□ 3.83
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CMTM4-204ENST00000563952 FAM161AQ3B820 660 aa38.96■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 SMC4Q9NTJ3 1288 aa38.96■■■■□ 3.83
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CMTM4-204ENST00000563952 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
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CMTM4-204ENST00000563952 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 GGA1Q9UJY5 639 aa38.95■■■■□ 3.83
CMTM4-204ENST00000563952 ITGA6P23229 1130 aa38.94■■■■□ 3.82
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