RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.83■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.83■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 APBA3O96018 575 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 TFCP2Q12800 502 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXO3Q9UK99 471 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM177BA6PVY3 158 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 CIAO1O76071 339 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 CASC1Q6TDU7 716 aa21.8■■□□□ 1.08
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USP3-AS1-208ENST00000560962 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.79■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 EYA2O00167 538 aa21.79■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHF14O94880 888 aa21.79■■□□□ 1.08
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USP3-AS1-208ENST00000560962 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMB2P55268 1798 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERC2O15083 957 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITGA6P23229 1130 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC24Q50LG9 513 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 SETDB2Q96T68 719 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-208ENST00000560962 TNNI3KQ59H18 835 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR108Q9NPR9 543 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.75■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC4A3P48751 1232 aa21.75■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.75■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMLP26374 656 aa21.74■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTL9Q8NET4 1388 aa21.74■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.73■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.72■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-208ENST00000560962 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.71■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-208ENST00000560962 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP26Q9BXU7 913 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.7■■□□□ 1.06
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USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFIXQ14938 502 aa21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF827Q17R98 1081 aa21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCC12Q96J65 1359 aa21.69■■□□□ 1.06
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USP3-AS1-208ENST00000560962 TIMM10P62072 90 aa21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF609O15014 1411 aa21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.67■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.67■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.67■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 EVI5LQ96CN4 794 aa21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP5JP18859 108 aa21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GUL7 405 aa21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TM4SF1P30408 202 aa21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 BECN1Q14457 450 aa21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 METTL24Q5JXM2 366 aa21.65■■□□□ 1.06
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