RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 C21orf2O43822 256 aa23.88■■□□□ 1.41
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RABGGTA-208ENST00000558954 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 COL4A1P02462 1669 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 CASP7P55210 303 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 CTSWP56202 376 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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RABGGTA-208ENST00000558954 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 RTL9Q8NET4 1388 aa23.83■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM27P14373 513 aa23.83■■□□□ 1.41
RABGGTA-208ENST00000558954 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.83■■□□□ 1.41
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RABGGTA-208ENST00000558954 BBOX1O75936 387 aa23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-208ENST00000558954 TMC4Q7Z404 712 aa23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-208ENST00000558954 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-208ENST00000558954 SNED1Q8TER0 1413 aa23.82■■□□□ 1.4
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RABGGTA-208ENST00000558954 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-208ENST00000558954 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.81■■□□□ 1.4
RABGGTA-208ENST00000558954 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.81■■□□□ 1.4
RABGGTA-208ENST00000558954 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.81■■□□□ 1.4
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RABGGTA-208ENST00000558954 RASSF7Q02833 373 aa23.8■■□□□ 1.4
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RABGGTA-208ENST00000558954 GREM2Q9H772 168 aa23.78■■□□□ 1.4
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RABGGTA-208ENST00000558954 USP44Q9H0E7 712 aa23.77■■□□□ 1.4
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RABGGTA-208ENST00000558954 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.74■■□□□ 1.39
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RABGGTA-208ENST00000558954 SLC51AQ86UW1 340 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-208ENST00000558954 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.73■■□□□ 1.39
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.71■■□□□ 1.39
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RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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RABGGTA-208ENST00000558954 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 RLBP1P12271 317 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 PSME4Q14997 1843 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 XDHP47989 1333 aa23.65■■□□□ 1.38
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