RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 TAF1P21675 1872 aa21.57■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.57■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 MSL1Q68DK7 614 aa21.57■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 GREM2Q9H772 168 aa21.57■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 NYXQ9GZU5 481 aa21.56■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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LGMN-216ENST00000557434 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.56■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.56■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 COPRSQ9NQ92 184 aa21.56■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.56■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.55■■□□□ 1.04
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LGMN-216ENST00000557434 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.55■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 APBB1O00213 710 aa21.54■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.54■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 LRP5O75197 1615 aa21.54■■□□□ 1.04
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LGMN-216ENST00000557434 CNBD1Q8NA66 436 aa21.53■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 SIL1Q9H173 461 aa21.53■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 SPEF2Q9C093 1822 aa21.52■■□□□ 1.04
LGMN-216ENST00000557434 SASH1O94885 1247 aa21.52■■□□□ 1.04
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LGMN-216ENST00000557434 ITGA6P23229 1130 aa21.52■■□□□ 1.04
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LGMN-216ENST00000557434 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.49■■□□□ 1.03
LGMN-216ENST00000557434 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LGMN-216ENST00000557434 RAB11FIP3O75154 756 aa21.48■■□□□ 1.03
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LGMN-216ENST00000557434 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.46■■□□□ 1.03
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LGMN-216ENST00000557434 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
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LGMN-216ENST00000557434 PDE1AP54750 535 aa21.36■■□□□ 1.01
LGMN-216ENST00000557434 AACSQ86V21 672 aa21.36■■□□□ 1.01
LGMN-216ENST00000557434 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.36■■□□□ 1.01
LGMN-216ENST00000557434 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LGMN-216ENST00000557434 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.36■■□□□ 1.01
LGMN-216ENST00000557434 MTFR1LQ9H019 292 aa21.36■■□□□ 1.01
LGMN-216ENST00000557434 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LGMN-216ENST00000557434 SRGNP10124 158 aa21.36■■□□□ 1.01
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