RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 FIBPO43427 364 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ATP5JP18859 108 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 RPS6KB1P23443 525 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 USP25Q9UHP3 1055 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 KDM4AO75164 1064 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ADCY5O95622 1261 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 MYL6BP14649 208 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 MYD88Q99836 296 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ABCC6O95255 1503 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 TMEM94Q12767 1356 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 CYP27B1O15528 508 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 TFCP2Q12800 502 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 KIF1AQ12756 1690 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ELP1O95163 1332 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF609O15014 1411 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 LIG1P18858 919 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PSMA5P28066 241 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 TNNI3KQ59H18 835 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 MPNDQ8N594 471 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 FSD1Q9BTV5 496 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 FOXO4P98177 505 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NBPF26B4DH59 902 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NBPF14Q5TI25 921 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 STOX1Q6ZVD7 989 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 FERMT3Q86UX7 667 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NBPF15Q8N660 670 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 HAUS7Q99871 368 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 H7C1W4 665 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 CYP21A2P08686 494 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD1Q15327 319 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PGBD1Q96JS3 809 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 JAK2O60674 1132 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 KCNJ4P48050 445 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 RESTQ13127 1097 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 RNF20Q5VTR2 975 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 DCAF5Q96JK2 942 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 LAMA4Q16363 1823 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 UQCRHP07919 91 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms