RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-208	ENST00000549107	TFCP2	Q12800	502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	AK7	Q96M32	723 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	EYA2	O00167	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ERC2	O15083	957 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	NTSR2	O95665	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	RXRB	P28702	533 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	LRP5	O75197	1615 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	GREM2	Q9H772	168 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF609	O15014	1411 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ZPR1	O75312	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ITGA6	P23229	1130 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	CHML	P26374	656 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRR-208	ENST00000549107	PHF14	O94880	888 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	RFC4	P35249	363 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	REC8	O95072	547 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	ATP5J	P18859	108 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107		A0A1B0GUL7	405 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	PROM2	Q8N271	834 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	PLSCR1	O15162	318 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	APBA3	O96018	575 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	SSFA2	P28290	1259 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	TIMM10	P62072	90 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22

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