RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 ZNF609O15014 1411 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 SIL1Q9H173 461 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 PALD1Q9ULE6 856 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 SPEF2Q9C093 1822 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-203ENST00000546585 SGSM2O43147 1006 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CAMTA2O94983 1202 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TFCP2Q12800 502 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TNNI3KQ59H18 835 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 AACSQ86V21 672 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 LRRC24Q50LG9 513 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 FAM89AQ96GI7 184 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TAF1P21675 1872 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 MYH7P12883 1935 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RGL2O15211 777 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RILPL2Q969X0 211 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 GPR108Q9NPR9 543 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RAD50Q92878 1312 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 MED23Q9ULK4 1368 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CIAO1O76071 339 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 REC8O95072 547 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 BECN1Q14457 450 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 KCNB2Q92953 911 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 EYA2O00167 538 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 PLSCR1O15162 318 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RPS6KA4O75676 772 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TRIM37O94972 964 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CHGBP05060 677 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ATP5JP18859 108 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 GPTP24298 496 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 HSPA4P34932 840 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RABEP1Q15276 862 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 NFKBIBQ15653 356 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 LAMA4Q16363 1823 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 DOCK2Q92608 1830 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CNTROBQ8N137 903 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 EVI5LQ96CN4 794 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 A0A0D9SFI3 127 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 NTSR2O95665 410 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 KCNQ4P56696 695 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 ANAPC15P60006 121 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 PTH1RQ03431 593 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 SUSD4Q5VX71 490 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 RASEFQ8IZ41 740 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 FAM227BQ96M60 508 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 GREM2Q9H772 168 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 FBXO3Q9UK99 471 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CTSWP56202 376 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 CASC1Q6TDU7 716 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 HAUS7Q99871 368 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-203ENST00000546585 TIMM10P62072 90 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms