RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLIT3O75094 1523 aa7.33□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP19O94966 1318 aa7.33□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOXC9P31274 260 aa7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL13P35225 146 aa7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POM121Q96HA1 1249 aa7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTMR7Q9Y216 660 aa7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PEAK1Q9H792 1746 aa7.32□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NFAT5O94916 1531 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDE3BQ13370 1112 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYPD8Q6UX82 237 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A6NJR5 290 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMOX1P09601 288 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM32Q13049 653 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAD21O60216 631 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRKAR2BP31323 418 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EVA1CP58658 441 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XP32Q5T750 250 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCA3Q99758 1704 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCC6O95255 1503 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IRF5Q13568 498 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCM6Q14566 821 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPDO75976 1380 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMPD1P17405 629 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CTHP32929 405 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIPK4P57078 832 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNH2Q12809 1159 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLIIQ13045 1269 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA0232Q92628 1395 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL18A1P39060 1754 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H3BM21 787 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RFC5P40937 340 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHRNA2Q15822 529 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NFE2L2Q16236 605 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GDF11O95390 407 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC27Q2M243 656 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR63Q8IWG1 891 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP10Q9P2G4 905 aa7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AP1G2O75843 785 aa7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GSK3AP49840 483 aa7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JCADQ9P266 1359 aa7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.26□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 E9PSI1 815 aa7.25□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AAMPQ13685 434 aa7.25□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.25□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.25□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RETREG2Q8NC44 543 aa7.25□□□□□ -1.25
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF4Q96M43 638 aa7.25□□□□□ -1.25
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