RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 NEURL1BA8MQ27 555 aa29.37■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 TOMM70O94826 608 aa29.37■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.37■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 SUPT20HQ8NEM7 779 aa29.37■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 MPNDQ8N594 471 aa29.36■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 LINS1Q8NG48 757 aa29.36■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 VPS33BQ9H267 617 aa29.35■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 CDHR2Q9BYE9 1310 aa29.35■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 RPS8P62241 208 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 LARGE2Q8N3Y3 721 aa29.33■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ME3-210ENST00000532471 H7C1W4 665 aa29.32■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 GCKRQ14397 625 aa29.32■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.32■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 LAMB2P55268 1798 aa29.31■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 SNED1Q8TER0 1413 aa29.29■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.29■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 F6X3S4 739 aa29.29■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 EIF6P56537 245 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.29■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 FZD9O00144 591 aa29.28■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 PPIP5K2O43314 1243 aa29.28■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 CTSWP56202 376 aa29.27■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 NIM1KQ8IY84 436 aa29.27■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.27■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
ME3-210ENST00000532471 BEND3Q5T5X7 828 aa29.26■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.25■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.25■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 SLC51AQ86UW1 340 aa29.25■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29.25■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.25■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 AOC3Q16853 763 aa29.24■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.24■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 FSTL1Q12841 308 aa29.23■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 GPC2Q8N158 579 aa29.23■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.23■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.23■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 POTECB2RU33 542 aa29.22■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 C6orf229H3BNL8 230 aa29.22■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 ALDH1L1O75891 902 aa29.22■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.22■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 PTPRCP08575 1304 aa29.21■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.21■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.21■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 WASHC4Q2M389 1173 aa29.21■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.21■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.21■■■□□ 2.27
ME3-210ENST00000532471 HSPA6P17066 643 aa29.2■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 GPSM2P81274 684 aa29.2■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 EYA3Q99504 573 aa29.2■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.2■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 GJA3Q9Y6H8 435 aa29.2■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 TAF1P21675 1872 aa29.2■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 GREM2Q9H772 168 aa29.19■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.19■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 WDR90Q96KV7 1748 aa29.18■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 CASP7P55210 303 aa29.18■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 RTL9Q8NET4 1388 aa29.17■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 GRM8O00222 908 aa29.17■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.17■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.17■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 HACL1Q9UJ83 578 aa29.17■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 CSF1RP07333 972 aa29.16■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 POLLQ9UGP5 575 aa29.16■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.15■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 GGA1Q9UJY5 639 aa29.15■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 G3V3G9 751 aa29.14■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 RIMBP2O15034 1052 aa29.14■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 ITGA6P23229 1130 aa29.14■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 TNIP1Q15025 636 aa29.14■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.14■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.14■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
ME3-210ENST00000532471 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.12■■■□□ 2.25
ME3-210ENST00000532471 UFL1O94874 794 aa29.12■■■□□ 2.25
ME3-210ENST00000532471 CXCL9Q07325 125 aa29.12■■■□□ 2.25
ME3-210ENST00000532471 CIAPIN1Q6FI81 312 aa29.12■■■□□ 2.25
ME3-210ENST00000532471 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms