RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.73■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.73■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 ECE1P42892 770 aa22.72■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 KRT24Q2M2I5 525 aa22.72■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 MPNDQ8N594 471 aa22.72■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.71■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 TCIRG1Q13488 830 aa22.71■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.71■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 ABHD8Q96I13 439 aa22.71■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
PKP3-208ENST00000531857 AOC2O75106 756 aa22.7■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 RAD17O75943 681 aa22.7■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.7■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.69■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 GRAPQ13588 217 aa22.69■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.69■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 COL4A1P02462 1669 aa22.68■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 SHTN1A0MZ66 631 aa22.68■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 YDJCA8MPS7 323 aa22.68■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.68■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.68■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.68■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 TSKSQ9UJT2 592 aa22.68■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.67■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.67■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 NEUROD2Q15784 382 aa22.67■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.67■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.67■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.66■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 TNIP1Q15025 636 aa22.66■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.66■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 CHL1O00533 1208 aa22.65■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 MAP2K2P36507 400 aa22.65■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PKP3-208ENST00000531857 RALBP1Q15311 655 aa22.64■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.64■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.63■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 DLK2Q6UY11 383 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 TMC4Q7Z404 712 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 FAM89AQ96GI7 184 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.61■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 MICALL2Q8IY33 904 aa22.61■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.61■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.61■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 SCN9AQ15858 1988 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 H7C1D1 291 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 WASHC4Q2M389 1173 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 USP48Q86UV5 1035 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 PSMD14O00487 310 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 RIMBP2O15034 1052 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 FAM161AQ3B820 660 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 POLLQ9UGP5 575 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.58■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 EGFRP00533 1210 aa22.58■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 GPSM2P81274 684 aa22.58■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 ZIC5Q96T25 663 aa22.58■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.58■■□□□ 1.21
PKP3-208ENST00000531857 C6orf229H3BNL8 230 aa22.57■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 DPF2Q92785 391 aa22.57■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 RUNDC1Q96C34 613 aa22.57■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 RTL9Q8NET4 1388 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 CA12O43570 354 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 HOXB7P09629 217 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 DOK7Q18PE1 504 aa22.55■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 ECE2O60344 883 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 HUNKP57058 714 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 PSME4Q14997 1843 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 HYPKQ9NX55 129 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PKP3-208ENST00000531857 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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