RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 RRAGCQ9HB90 399 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 GLTPD2A6NH11 291 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 PSMD1Q99460 953 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 BBOX1O75936 387 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 MYH3P11055 1940 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 PDE8AO60658 829 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 GCKRQ14397 625 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 SP8Q8IXZ3 490 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 LINS1Q8NG48 757 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 CTSWP56202 376 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 WDR90Q96KV7 1748 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 SPEF2Q9C093 1822 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 H7C1W4 665 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 AOC3Q16853 763 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 BEND3Q5T5X7 828 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 PPIP5K2O43314 1243 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 CASP7P55210 303 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 MPNDQ8N594 471 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 POTECB2RU33 542 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 GREM2Q9H772 168 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 LTBP1Q14766 1721 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 FZD9O00144 591 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 GPSM2P81274 684 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 TMC4Q7Z404 712 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-211ENST00000531385 TOMM70O94826 608 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 JDP2Q8WYK2 163 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 FAM161AQ3B820 660 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 NIM1KQ8IY84 436 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 POLLQ9UGP5 575 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 RTL9Q8NET4 1388 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 C6orf229H3BNL8 230 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 GRM8O00222 908 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 RIMBP2O15034 1052 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 PTPRCP08575 1304 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-211ENST00000531385 ALDH1L1O75891 902 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 POTEIP0CG38 1075 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 POTEJP0CG39 1038 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 FOXO4P98177 505 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 CEP350Q5VT06 3117 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 SCN4AP35499 1836 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 UFL1O94874 794 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 ITGA6P23229 1130 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 CSF1RP07333 972 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 GPC2Q8N158 579 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 YDJCA8MPS7 323 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 HSPA6P17066 643 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 WASHC4Q2M389 1173 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 SUCLG2Q96I99 432 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 VPS33BQ9H267 617 aa23.73■■□□□ 1.39
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