RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 GRAPQ13588 217 aa24.02■■□□□ 1.44
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TSTA3-211ENST00000529899 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.02■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 WDR90Q96KV7 1748 aa24.01■■□□□ 1.43
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TSTA3-211ENST00000529899 LINS1Q8NG48 757 aa23.93■■□□□ 1.42
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TSTA3-211ENST00000529899 PPIP5K2O43314 1243 aa23.92■■□□□ 1.42
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TSTA3-211ENST00000529899 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.91■■□□□ 1.42
TSTA3-211ENST00000529899 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TSTA3-211ENST00000529899 GREM2Q9H772 168 aa23.91■■□□□ 1.42
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TSTA3-211ENST00000529899 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.89■■□□□ 1.41
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TSTA3-211ENST00000529899 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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TSTA3-211ENST00000529899 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
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TSTA3-211ENST00000529899 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.84■■□□□ 1.41
TSTA3-211ENST00000529899 SCN9AQ15858 1988 aa23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-211ENST00000529899 A0A1B0GUL6 1792 aa23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-211ENST00000529899 C6orf229H3BNL8 230 aa23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-211ENST00000529899 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-211ENST00000529899 FOXO4P98177 505 aa23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-211ENST00000529899 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-211ENST00000529899 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.83■■□□□ 1.41
TSTA3-211ENST00000529899 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.83■■□□□ 1.4
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TSTA3-211ENST00000529899 GPC2Q8N158 579 aa23.82■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.82■■□□□ 1.4
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TSTA3-211ENST00000529899 RAD17O75943 681 aa23.81■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 UFL1O94874 794 aa23.81■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 ITGA6P23229 1130 aa23.81■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.81■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.81■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 CSF1RP07333 972 aa23.8■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 SCNN1DP51172 638 aa23.8■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 DOK7Q18PE1 504 aa23.8■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 WASHC4Q2M389 1173 aa23.8■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.8■■□□□ 1.4
TSTA3-211ENST00000529899 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
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