RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526290.1

TSTA3-204, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-204ENST00000526290 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 WWC1Q8IX03 1113 aa21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 TSPYL6Q8N831 410 aa21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC27Q2M243 656 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 MYD88Q99836 296 aa21.63■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 TMC4Q7Z404 712 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 CREBZFQ9NS37 354 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 TAF1P21675 1872 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 EPS15P42566 896 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 PASKQ96RG2 1323 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 SCNN1DP51172 638 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 CXCL9Q07325 125 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 CNTROBQ8N137 903 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 STK31Q9BXU1 1019 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-204ENST00000526290 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 IFFO2Q5TF58 517 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 IL16Q14005 1332 aa21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 KSR2Q6VAB6 950 aa21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.55■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 RAD17O75943 681 aa21.55■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.55■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 C6orf229H3BNL8 230 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 GPSM2P81274 684 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 TNIP1Q15025 636 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 WASHC4Q2M389 1173 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 PDE8AO60658 829 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 SLC4A2P04920 1241 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 LTBP1Q14766 1721 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 RIMBP2O15034 1052 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 G2E3Q7L622 706 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 WDR63Q8IWG1 891 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 POLLQ9UGP5 575 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-204ENST00000526290 YDJCA8MPS7 323 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 IGKV5-2P06315 115 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 EYA3Q99504 573 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 COL4A1P02462 1669 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 CNTNAP1P78357 1384 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 DOK7Q18PE1 504 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 VAMP4O75379 141 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 VEGFBP49765 207 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 FLIIQ13045 1269 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSTA3-204ENST00000526290 G3V3G9 751 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms