RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523338.5

TNIP1-218, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP1, Length 2,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-218ENST00000523338 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.01□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.011e-7■■■□□ 17.7
TNIP1-218ENST00000523338 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 A0A0G2JLW4 131 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 F13A1P00488 732 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 PLCB2Q00722 1185 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 PLBD2Q8NHP8 589 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 COPRSQ9NQ92 184 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 IL17RAQ96F46 866 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 SNRKQ9NRH2 765 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 TNS3Q68CZ2 1445 aa15□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 COL15A1P39059 1388 aa14.99□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 SYNE4Q8N205 404 aa14.99□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 TAF5LO75529 589 aa14.99□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.99□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 MTMR6Q9Y217 621 aa14.99□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 FOXO4P98177 505 aa14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 DDX11Q96FC9 970 aa14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 CHST3Q7LGC8 479 aa14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 TSPY26PQ9H489 355 aa14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 HIP1O00291 1037 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 FAM89AQ96GI7 184 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 ALS2Q96Q42 1657 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 JAK2O60674 1132 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 ATP5JP18859 108 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 CASP7P55210 303 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 RNF20Q5VTR2 975 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 SLAIN2Q9P270 581 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.96□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 RPS6KB1P23443 525 aa14.96□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 GPTP24298 496 aa14.96□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 PSMA5P28066 241 aa14.96□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.96□□□□□ -0.01
TNIP1-218ENST00000523338 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.96□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 IL2RBP14784 551 aa14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 CAMK4Q16566 473 aa14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 CYP21A2P08686 494 aa14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 ZNF609O15014 1411 aa14.95□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 H7C1W4 665 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 Q6ZUG5 572 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 KIF1AQ12756 1690 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 KCNB2Q92953 911 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 BRF1Q92994 677 aa14.94□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 MED23Q9ULK4 1368 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 PI16Q6UXB8 463 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 NEK1Q96PY6 1258 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 HAUS7Q99871 368 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 USP25Q9UHP3 1055 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 A0A1B0GUL7 405 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 ADORA1P30542 326 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 GORABQ5T7V8 394 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 UBE2HP62256 183 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 COL18A1P39060 1754 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 HAND2P61296 217 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 FAM177BA6PVY3 158 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-218ENST00000523338 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms