RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 ZFATQ9P243 1243 aa8.22□□□□□ -1.09
CPEB4-210ENST00000522344 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.22□□□□□ -1.09
CPEB4-210ENST00000522344 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.21□□□□□ -1.1
CPEB4-210ENST00000522344 ATCAYQ86WG3 371 aa8.21□□□□□ -1.1
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CPEB4-210ENST00000522344 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.18□□□□□ -1.1
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CPEB4-210ENST00000522344 GNB5O14775 395 aa8.17□□□□□ -1.1
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CPEB4-210ENST00000522344 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.17□□□□□ -1.1
CPEB4-210ENST00000522344 MMP20O60882 483 aa8.16□□□□□ -1.1
CPEB4-210ENST00000522344 MAP3K6O95382 1288 aa8.16□□□□□ -1.1
CPEB4-210ENST00000522344 PSAPP07602 524 aa8.16□□□□□ -1.1
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CPEB4-210ENST00000522344 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.16□□□□□ -1.1
CPEB4-210ENST00000522344 NLRP13Q86W25 1043 aa8.16□□□□□ -1.1
CPEB4-210ENST00000522344 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.16□□□□□ -1.1
CPEB4-210ENST00000522344 TTC16Q8NEE8 873 aa8.16□□□□□ -1.1
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CPEB4-210ENST00000522344 GPLD1P80108 840 aa8.13□□□□□ -1.11
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CPEB4-210ENST00000522344 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.13□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM11Q96F44 468 aa8.13□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 DCAF5Q96JK2 942 aa8.13□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 POLIQ9UNA4 740 aa8.13□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.12□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 A6NHS1 94 aa8.12□□□□□ -1.11
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CPEB4-210ENST00000522344 J3QW42 95 aa8.12□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 NRLP54845 237 aa8.12□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.12□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.12□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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CPEB4-210ENST00000522344 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 PERM1Q5SV97 790 aa8.11□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 NPR3P17342 541 aa8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 SIK1P57059 783 aa8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CPEB4-210ENST00000522344 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.1□□□□□ -1.11
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