RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 SOGA3Q5TF21 947 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 NLRP13Q86W25 1043 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 RUNDC1Q96C34 613 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF208Q9H0X6 261 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 NLRP2Q9NX02 1062 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCN11AQ9UI33 1791 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRC1P22897 1456 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF13BQ9NQT8 1826 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 TLL1O43897 1013 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADRB1P08588 477 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGFBP4P22692 258 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 SP3Q02447 781 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLA2Q14181 598 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGEF6Q15052 776 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRT26Q7Z3Y9 468 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 JDP2Q8WYK2 163 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-548P-201ENST00000517083 NCOR1O75376 2440 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 C4AP0C0L4 1744 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCC11Q96J66 1382 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SHTN1A0MZ66 631 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADM5C9JUS6 153 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCXO43602 365 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 IARSP41252 1262 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SIK1P57059 783 aa3.02□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LRSAM1Q6UWE0 723 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMC4Q7Z404 712 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 GJD3Q8N144 294 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 MICALL1Q8N3F8 863 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PRDM12Q9H4Q4 367 aa3.02□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.01□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa3.01□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SBF1O95248 1867 aa3.01□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 H0Y858 1186 aa3□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGAP6O43182 974 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJB2P25686 324 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 TM4SF1P30408 202 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 IRS1P35568 1242 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6V1AP38606 617 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCR10P46092 362 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRHR2Q13324 411 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf50Q5SZB4 431 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM132EQ6IEE7 984 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUTM1Q86Y26 1132 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNL1Q8IU54 200 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SP8Q8IXZ3 490 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3□□□□□ -1.93
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