RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CTSWP56202 376 aa16.91■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A1B0GUL6 1792 aa16.9■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.9■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 UTYO14607 1347 aa16.9■□□□□ 0.3
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RLBP1P12271 317 aa16.89■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.89■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 OLFM4Q6UX06 510 aa16.89■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SUCLG2Q96I99 432 aa16.89■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.89■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP44Q9H0E7 712 aa16.89■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.88■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C21orf2O43822 256 aa16.88■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PLIN1O60240 522 aa16.88■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ALDH1B1P30837 517 aa16.88■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.88■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.88■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.88■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SNED1Q8TER0 1413 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LTBP1Q14766 1721 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FOXO4P98177 505 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GRAPQ13588 217 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM161AQ3B820 660 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KAZALD1Q96I82 304 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MEIS3Q99687 375 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GREM2Q9H772 168 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RTL9Q8NET4 1388 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.87■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GRIN3BO60391 1043 aa16.86■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PANK1Q8TE04 598 aa16.86■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RASSF7Q02833 373 aa16.85■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.85■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CSF1RP07333 972 aa16.84■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.84■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16.84■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.84■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NFKBIEO00221 500 aa16.83■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.83■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.83■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BBOX1O75936 387 aa16.82■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ITGA6P23229 1130 aa16.82■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC93Q567U6 631 aa16.82■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.82■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.82■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PRELPP51888 382 aa16.81■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SOGA3Q5TF21 947 aa16.81■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.8■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GNAI3P08754 354 aa16.79■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SP8Q8IXZ3 490 aa16.79■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.79■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COL4A5P29400 1685 aa16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MS4A1P11836 297 aa16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMC4Q7Z404 712 aa16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 COG6Q9Y2V7 657 aa16.78■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RTKN2Q8IZC4 609 aa16.77■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.77■□□□□ 0.28
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GPSM2P81274 684 aa16.76■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PDE3AQ14432 1141 aa16.76■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.76■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GNAI2P04899 355 aa16.75■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LMNB1P20700 586 aa16.75■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.75■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.75■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PSMD1Q99460 953 aa16.75■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RNF181Q9P0P0 153 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms