RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
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MSC-AS1-202ENST00000512290 TSC1Q92574 1164 aa10.57□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.57□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.57□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
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MSC-AS1-202ENST00000512290 MPNDQ8N594 471 aa10.53□□□□□ -0.72
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MSC-AS1-202ENST00000512290 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.53□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 BCS1LQ9Y276 419 aa10.53□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 NHSQ6T4R5 1651 aa10.53□□□□□ -0.72
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MSC-AS1-202ENST00000512290 FOXJ1Q92949 421 aa10.52□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 USP47Q96K76 1375 aa10.52□□□□□ -0.73
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MSC-AS1-202ENST00000512290 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARID5BQ14865 1188 aa10.51□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
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MSC-AS1-202ENST00000512290 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.51□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 QPCTQ16769 361 aa10.5□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.5□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 PAPPAQ13219 1627 aa10.5□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL18A1P39060 1754 aa10.49□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 WNK3Q9BYP7 1800 aa10.49□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A0G2JLW4 131 aa10.48□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 LILRB3O75022 631 aa10.48□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.48□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.48□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.48□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFP42Q96MM3 310 aa10.48□□□□□ -0.73
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MSC-AS1-202ENST00000512290 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.47□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa10.47□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLIT3O75094 1523 aa10.47□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.46□□□□□ -0.73
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMIM5Q71RC9 77 aa10.46□□□□□ -0.73
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MSC-AS1-202ENST00000512290 CDK15Q96Q40 435 aa10.46□□□□□ -0.73
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCC6O95255 1503 aa10.46□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.46□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 WDR90Q96KV7 1748 aa10.46□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 TIMP2P16035 220 aa10.45□□□□□ -0.74
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MSC-AS1-202ENST00000512290 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 TGFB2P61812 414 aa10.44□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF181Q9P0P0 153 aa10.44□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.44□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL24A1Q17RW2 1714 aa10.44□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 MMP10P09238 476 aa10.43□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.43□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE2CQ5TA81 110 aa10.43□□□□□ -0.74
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MSC-AS1-202ENST00000512290 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 AIDAQ96BJ3 306 aa10.43□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.43□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 DPEP1P16444 411 aa10.42□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 AMPHP49418 695 aa10.42□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 NR5A1Q13285 461 aa10.42□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 NME9Q86XW9 330 aa10.42□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.42□□□□□ -0.74
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
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MSC-AS1-202ENST00000512290 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
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