RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512247.5

LNX1-208, Transcript of ligand of numb-protein X 1, human

TSL 3

Gene LNX1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LNX1-208	ENST00000512247	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	RGL2	O15211	777 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	NEFM	P07197	916 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LNX1-208	ENST00000512247	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.21	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	MPND	Q8N594	471 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	SLC10A3	P09131	477 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	MYL6B	P14649	208 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	MCM10	Q7L590	875 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	ABCC4	O15439	1325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	PSMD14	O00487	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	BBOX1	O75936	387 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	EGFR	P00533	1210 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	PRKAR2B	P31323	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	NTSR2	O95665	410 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	DPF2	Q92785	391 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LNX1-208	ENST00000512247	GPR25	O00155	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247		G3V3G9	751 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	FKTN	O75072	461 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	GRAP	Q13588	217 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	CCDC184	Q52MB2	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	DLL1	O00548	723 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	ECE2	O60344	883 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	SCARF1	Q14162	830 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LNX1-208	ENST00000512247	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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