RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 COL26A1Q96A83 441 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PRU2 124 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 A6NJY4 79 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 IL2RAP01589 272 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 CNKSR1Q969H4 720 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 HRH3Q9Y5N1 445 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 LGR5O75473 907 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 KCNA6P17658 529 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 FOXK2Q01167 660 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 ADGRB3O60242 1522 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 CDK2AP1O14519 115 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 C21orf2O43822 256 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 SCNN1AP37088 669 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 SERPINB4P48594 390 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 TLR1Q15399 786 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 MEIOBQ8N635 442 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 HPS1Q92902 700 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 NLRP3Q96P20 1036 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 EP400Q96L91 3159 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 MSH6P52701 1360 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 RGS12O14924 1447 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 CENPCQ03188 943 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 CCDC27Q2M243 656 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 NBPF15Q8N660 670 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 EID1Q9Y6B2 187 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 RELBQ01201 579 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 VTI1AQ96AJ9 217 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 MKNK1Q9BUB5 465 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 ZFYVE9O95405 1425 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 MEN1O00255 615 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 GPC1P35052 558 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 IDI1Q13907 227 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 NOS1P29475 1434 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 TRPM2O94759 1503 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 RGL3Q3MIN7 710 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 SEPT3Q9UH03 358 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 E9PCH4 1651 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 ABL1P00519 1130 aa10.21□□□□□ -0.77
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HERC3-210ENST00000512194 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
HERC3-210ENST00000512194 ICMTO60725 284 aa10.2□□□□□ -0.78
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HERC3-210ENST00000512194 RXRBP28702 533 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
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HERC3-210ENST00000512194 TBCELQ5QJ74 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 AFF2P51816 1311 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 SPINT1O43278 529 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 CAPN12Q6ZSI9 719 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 RGS22Q8NE09 1264 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 USP3Q9Y6I4 520 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC3-210ENST00000512194 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.19□□□□□ -0.78
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