RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GLTPD2A6NH11 291 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SLFN5Q08AF3 891 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD1Q99460 953 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 E9PSI1 815 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 F6X3S4 739 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 RRAGCQ9HB90 399 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SCN9AQ15858 1988 aa23.89■■□□□ 1.42
SH3BP2-218ENST00000511185 POTECB2RU33 542 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PSME4Q14997 1843 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE8AO60658 829 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GCKRQ14397 625 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 BBOX1O75936 387 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CTSWP56202 376 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SP8Q8IXZ3 490 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP7P55210 303 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 AOC3Q16853 763 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 LINS1Q8NG48 757 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP350Q5VT06 3117 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 BEND3Q5T5X7 828 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 H7C1W4 665 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 FZD9O00144 591 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PPIP5K2O43314 1243 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TOMM70O94826 608 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 MPNDQ8N594 471 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GREM2Q9H772 168 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GPSM2P81274 684 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TMC4Q7Z404 712 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 RTL9Q8NET4 1388 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM161AQ3B820 660 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 JDP2Q8WYK2 163 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 POTEIP0CG38 1075 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 POTEJP0CG39 1038 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 NIM1KQ8IY84 436 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 POLLQ9UGP5 575 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA6P17066 643 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 YDJCA8MPS7 323 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 GPC2Q8N158 579 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 GRM8O00222 908 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXO4P98177 505 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRCP08575 1304 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf229H3BNL8 230 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMBP2O15034 1052 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 UFL1O94874 794 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA6P23229 1130 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SCNN1DP51172 638 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH1L1O75891 902 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CSF1RP07333 972 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.72■■□□□ 1.39
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