RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 MYH3P11055 1940 aa30.1■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 GLTPD2A6NH11 291 aa30.1■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.1■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 DPY19L2Q6NUT2 758 aa30.1■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 SP8Q8IXZ3 490 aa30.1■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 TAF1P21675 1872 aa30.1■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.09■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 C1QTNF8P60827 252 aa30.08■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 GCKRQ14397 625 aa30.08■■■□□ 2.41
PITX1-206ENST00000507253 KIF3CO14782 793 aa30.07■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.07■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.07■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa30.06■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 F6X3S4 739 aa30.05■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 H7C1W4 665 aa30.05■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.05■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 PTPRCP08575 1304 aa30.04■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 CTSWP56202 376 aa30.04■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 JDP2Q8WYK2 163 aa30.04■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 WDR90Q96KV7 1748 aa30.03■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 BEND3Q5T5X7 828 aa30.03■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 MPNDQ8N594 471 aa30.03■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 VPS33BQ9H267 617 aa30.03■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 RPS8P62241 208 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.02■■■□□ 2.4
PITX1-206ENST00000507253 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.01■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 SLC4A10Q6U841 1118 aa30■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 SLC51AQ86UW1 340 aa30■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 RRAGCQ9HB90 399 aa30■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 RTL9Q8NET4 1388 aa30■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 ALDH1L1O75891 902 aa29.99■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 TOMM70O94826 608 aa29.99■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.99■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 PPIP5K2O43314 1243 aa29.98■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.98■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.98■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.98■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 COL4A1P02462 1669 aa29.98■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 FZD9O00144 591 aa29.97■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 CASP7P55210 303 aa29.97■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29.97■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 NIM1KQ8IY84 436 aa29.97■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.97■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.95■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 EIF6P56537 245 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
PITX1-206ENST00000507253 GRM8O00222 908 aa29.94■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 AOC3Q16853 763 aa29.94■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 GREM2Q9H772 168 aa29.94■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.94■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 LTBP1Q14766 1721 aa29.93■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 COL4A5P29400 1685 aa29.93■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.93■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 SCN4AP35499 1836 aa29.92■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 SPEF2Q9C093 1822 aa29.92■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.91■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 GPC2Q8N158 579 aa29.91■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 EYA3Q99504 573 aa29.91■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 GPSM2P81274 684 aa29.9■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.9■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 C6orf229H3BNL8 230 aa29.89■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 CSF1RP07333 972 aa29.89■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.89■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.89■■■□□ 2.38
PITX1-206ENST00000507253 ITGA6P23229 1130 aa29.88■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 FAM161AQ3B820 660 aa29.88■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.88■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 WASHC4Q2M389 1173 aa29.87■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 XDHP47989 1333 aa29.87■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 KIF16BQ96L93 1317 aa29.87■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 POTECB2RU33 542 aa29.86■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 FSTL1Q12841 308 aa29.86■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.86■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 GGA1Q9UJY5 639 aa29.86■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.85■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 FOXO4P98177 505 aa29.85■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
PITX1-206ENST00000507253 POLLQ9UGP5 575 aa29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms