RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506401.6

ITGA3-207, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 1,817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-207ENST00000506401 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 PDE1AP54750 535 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 FBXO3Q9UK99 471 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 LAMB2P55268 1798 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 MX1P20591 662 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF827Q17R98 1081 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-207ENST00000506401 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 ITGA6P23229 1130 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 C8orf34Q49A92 452 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 ERFEQ4G0M1 354 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 TTC22Q5TAA0 569 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 GREM2Q9H772 168 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 STAP2Q9UGK3 403 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 EYA2O00167 538 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 CIAO1O76071 339 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 GYS1P13807 737 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 BAG6P46379 1132 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 NFIXQ14938 502 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 AOX1Q06278 1338 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 TFCP2Q12800 502 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 AACSQ86V21 672 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 NPHP1O15259 732 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 MSH5O43196 834 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 GPATCH3Q96I76 525 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 LRRC24Q50LG9 513 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 RTL9Q8NET4 1388 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-207ENST00000506401 TM4SF1P30408 202 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 TNNI3KQ59H18 835 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 NLRP3Q96P20 1036 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 ERC2O15083 957 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 GPR108Q9NPR9 543 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 STK32BQ9NY57 414 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 CCDC125Q86Z20 511 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 CNBD1Q8NA66 436 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 ABCC12Q96J65 1359 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 SLC15A2Q16348 729 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 SERPINB2P05120 415 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 SDSP20132 328 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 CASZ1Q86V15 1759 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 ST5P78524 1137 aa21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 METTL24Q5JXM2 366 aa21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.83■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 CDC45O75419 566 aa21.83■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.83■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.83■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.83■■□□□ 1.09
ITGA3-207ENST00000506401 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.83■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.82■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.82■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 TIMM10P62072 90 aa21.8■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 DDR1Q08345 913 aa21.8■■□□□ 1.08
ITGA3-207ENST00000506401 CASC1Q6TDU7 716 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms