RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 JDP2Q8WYK2 163 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-210ENST00000505941 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 RRAGCQ9HB90 399 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 LAMB2P55268 1798 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 MPNDQ8N594 471 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 GCKRQ14397 625 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF3CO14782 793 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 VPS33BQ9H267 617 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 F6X3S4 739 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-210ENST00000505941 H7C1W4 665 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 TOMM70O94826 608 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PPIP5K2O43314 1243 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CTSWP56202 376 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPRCP08575 1304 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 BEND3Q5T5X7 828 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 NIM1KQ8IY84 436 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-210ENST00000505941 FZD9O00144 591 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH1L1O75891 902 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 SNED1Q8TER0 1413 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 C6orf229H3BNL8 230 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 AOC3Q16853 763 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 TAF1P21675 1872 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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SH3BP2-210ENST00000505941 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 GRM8O00222 908 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 WASHC4Q2M389 1173 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC51AQ86UW1 340 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 GPC2Q8N158 579 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 GREM2Q9H772 168 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 CASP7P55210 303 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 GPSM2P81274 684 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 RTL9Q8NET4 1388 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP2-210ENST00000505941 G3V3G9 751 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 FSTL1Q12841 308 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 GGA1Q9UJY5 639 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 MYH3P11055 1940 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CSF1RP07333 972 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ITGA6P23229 1130 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR90Q96KV7 1748 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 RIMBP2O15034 1052 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 HACL1Q9UJ83 578 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 POTECB2RU33 542 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 UFL1O94874 794 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 TNIP1Q15025 636 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 POLLQ9UGP5 575 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2-210ENST00000505941 XDHP47989 1333 aa26.6■■□□□ 1.85
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