RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 AIDAQ96BJ3 306 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 EREGO14944 169 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 PHKA2P46019 1235 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 SPON2Q9BUD6 331 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-209ENST00000504994 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ATP4AP20648 1035 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 GPC1P35052 558 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 NFE2L2Q16236 605 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 CNTN3Q9P232 1028 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 TIMP2P16035 220 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 MAP3K10Q02779 954 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 GSTT1P30711 240 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 VEGFBP49765 207 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 MEIOBQ8N635 442 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 NBPF4Q96M43 638 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SLC19A1P41440 591 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.18□□□□□ -1.26
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HERC3-209ENST00000504994 XYLBO75191 536 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 HSD3B2P26439 372 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ETFBP38117 255 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 TYRO3Q06418 890 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 PTPROQ16827 1216 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ZIC5Q96T25 663 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 GINM1Q9NU53 330 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 A0A1W2PP55 124 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 J3QL48 77 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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HERC3-209ENST00000504994 FOXC1Q12948 553 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SPRYD7Q5W111 196 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 MKL1Q969V6 931 aa7.16□□□□□ -1.26
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HERC3-209ENST00000504994 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ENPP3O14638 875 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 RAB11FIP3O75154 756 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 FBXO24O75426 580 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SOX9P48436 509 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 FCGRTP55899 365 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 POU4F2Q12837 409 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 PWP1Q13610 501 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 KCNB2Q92953 911 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 RHOVQ96L33 236 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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