RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 TNNI3KQ59H18 835 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF6Q6ZMV9 814 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 IL27Q8NEV9 243 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR108Q9NPR9 543 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 SNRKQ9NRH2 765 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 PALD1Q9ULE6 856 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 CSF1RP07333 972 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP5JP18859 108 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 MCCP23508 829 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 MTFR1LQ9H019 292 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 RAD50Q92878 1312 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 CIAO1O76071 339 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 HLFQ16534 295 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNB2Q92953 911 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 SYT17Q9BSW7 474 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 EYA2O00167 538 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 HIP1O00291 1037 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ST18O60284 1047 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 IL15P40933 162 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF827Q17R98 1081 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP10Q86W26 655 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 RUFY2Q8WXA3 655 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO3Q9UK99 471 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 MCM2P49736 904 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF5P55010 431 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ARXQ96QS3 562 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 BOLA2Q9H3K6 86 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 NHSQ6T4R5 1651 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 MCM4P33991 863 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNQ4P56696 695 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 DBNDD2Q9BQY9 259 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 AK9Q5TCS8 1911 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 NEK4P51957 841 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 PTH1RQ03431 593 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CUL4AQ13619 759 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC24Q50LG9 513 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 TICAM2Q86XR7 235 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM89AQ96GI7 184 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 HAUS7Q99871 368 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC87Q9NVE4 849 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 RFX7Q2KHR2 1363 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 SIK1P57059 783 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ITPK1Q13572 414 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 RASEFQ8IZ41 740 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 NECTIN1Q15223 517 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR162Q16538 588 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNE4Q8N205 404 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP4K1Q92918 833 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM227BQ96M60 508 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC14Q96N46 770 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 MED23Q9ULK4 1368 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF609O15014 1411 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 BTAF1O14981 1849 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BP2-209ENST00000504450 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 GPTP24298 496 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V1AP38606 617 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 CRKLP46109 303 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 TIMM10P62072 90 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 TMX3Q96JJ7 454 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-209ENST00000504450 FSD1Q9BTV5 496 aa13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms