RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNE4Q8N205 404 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 UTYO14607 1347 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 SP8Q8IXZ3 490 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 RTL9Q8NET4 1388 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 GNAI3P08754 354 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 VPS33BQ9H267 617 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCC4O15439 1325 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 CSF1RP07333 972 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 CASP7P55210 303 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM27P14373 513 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMD1Q99460 953 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 LMNB1P20700 586 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 23.3
SH3BP2-208ENST00000504294 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 LAMB2P55268 1798 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 USP44Q9H0E7 712 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MPNDQ8N594 471 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ITGA6P23229 1130 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 YY1P25490 414 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXO4P98177 505 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 LMBR1LQ6UX01 489 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 EYA3Q99504 573 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 GREM2Q9H772 168 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PDE3AQ14432 1141 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SUCLG2Q96I99 432 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF181Q9P0P0 153 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SLX4Q8IY92 1834 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 NFKBIEO00221 500 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 JDP2Q8WYK2 163 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 GNAI2P04899 355 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM161AQ3B820 660 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CHD4Q14839 1912 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP2B4P23634 1241 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXO3Q9UK99 471 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 XDHP47989 1333 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 MYH3P11055 1940 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 RASSF7Q02833 373 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 GGA1Q9UJY5 639 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 C6orf229H3BNL8 230 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 MEIS3Q99687 375 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CNNM1Q9NRU3 951 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 G3V3G9 751 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 WASHC4Q2M389 1173 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 EPHA10Q5JZY3 1008 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 KAZALD1Q96I82 304 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.8 ms