RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 SMIM5Q71RC9 77 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 SH3TC1Q8TE82 1336 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 CNTROBQ8N137 903 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 GNPATO15228 680 aa31.78■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 FBXO3Q9UK99 471 aa31.78■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 AK7Q96M32 723 aa31.78■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
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HOXB3-212ENST00000498678 GREM2Q9H772 168 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 USP26Q9BXU7 913 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXB3-212ENST00000498678 NTSR2O95665 410 aa31.76■■■□□ 2.67
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HOXB3-212ENST00000498678 GPR108Q9NPR9 543 aa31.76■■■□□ 2.67
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HOXB3-212ENST00000498678 SLC4A3P48751 1232 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-212ENST00000498678 TAF7LQ5H9L4 462 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-212ENST00000498678 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXB3-212ENST00000498678 BCL2L12Q9HB09 334 aa31.74■■■□□ 2.67
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HOXB3-212ENST00000498678 USPL1Q5W0Q7 1092 aa31.71■■■□□ 2.67
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HOXB3-212ENST00000498678 BOLA2Q9H3K6 86 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXB3-212ENST00000498678 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.71■■■□□ 2.67
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HOXB3-212ENST00000498678 ZNF609O15014 1411 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-212ENST00000498678 ZPR1O75312 459 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-212ENST00000498678 BECN1Q14457 450 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-212ENST00000498678 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB3-212ENST00000498678 NEUROD6Q96NK8 337 aa31.68■■■□□ 2.66
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HOXB3-212ENST00000498678 RTL9Q8NET4 1388 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXB3-212ENST00000498678 RFC4P35249 363 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXB3-212ENST00000498678 METTL24Q5JXM2 366 aa31.61■■■□□ 2.65
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HOXB3-212ENST00000498678 LRP5O75197 1615 aa31.59■■■□□ 2.65
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HOXB3-212ENST00000498678 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
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HOXB3-212ENST00000498678 COL24A1Q17RW2 1714 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 ADORA1P30542 326 aa31.56■■■□□ 2.64
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