RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	GYS1	P13807	737 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	MYH7	P12883	1935 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	CIAO1	O76071	339 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	NFIX	Q14938	502 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	TM4SF1	P30408	202 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	SIL1	Q9H173	461 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	GREM2	Q9H772	168 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PKP4-215	ENST00000494945	EYA2	O00167	538 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	SASH1	O94885	1247 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	ITGA6	P23229	1130 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	AOX1	Q06278	1338 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	MSH5	O43196	834 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	MX1	P20591	662 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	PDE1A	P54750	535 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	COL4A1	P02462	1669 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	NPHP1	O15259	732 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	SERPINB2	P05120	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	ST5	P78524	1137 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF609	O15014	1411 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	DDR1	Q08345	913 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	TFCP2	Q12800	502 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	AACS	Q86V21	672 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKP4-215	ENST00000494945	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKP4-215	ENST00000494945	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKP4-215	ENST00000494945	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKP4-215	ENST00000494945	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKP4-215	ENST00000494945	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKP4-215	ENST00000494945	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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