RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493316.5

CFAP74-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 74, human

TSL 4

Gene CFAP74, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP74-208	ENST00000493316	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	PSME4	Q14997	1843 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	NTSR2	O95665	410 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	DGKZ	Q13574	1117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	CST9	Q5W186	159 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	APAF1	O14727	1248 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	HOXB7	P09629	217 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	AOC3	Q16853	763 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	CRY2	Q49AN0	593 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	SUSD4	Q5VX71	490 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	ZIC5	Q96T25	663 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CFAP74-208	ENST00000493316	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	CCDC184	Q52MB2	194 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	JDP2	Q8WYK2	163 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	MBIP	Q9NS73	344 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF853	P0CG23	659 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	NOG	Q13253	232 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	IFT57	Q9NWB7	429 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	ALDH1B1	P30837	517 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	GNAI1	P63096	354 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	NLRP10	Q86W26	655 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	PSMD1	Q99460	953 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	ABCC4	O15439	1325 aa		10	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	PPIP5K2	O43314	1243 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	YDJC	A8MPS7	323 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	RAD17	O75943	681 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	EGFR	P00533	1210 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	TCIRG1	Q13488	830 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316		A0A1B0GUL6	1792 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	CXCL9	Q07325	125 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	NIM1K	Q8IY84	436 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	NLRP3	Q96P20	1036 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	VPS33B	Q9H267	617 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	MRS2	Q9HD23	443 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	HYPK	Q9NX55	129 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	MYH3	P11055	1940 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CFAP74-208	ENST00000493316	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	ANP32C	O43423	234 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	GOLGA2	Q08379	1002 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	CCDC27	Q2M243	656 aa		9.95	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	ADM5	C9JUS6	153 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	SOX10	P56693	466 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	WWC1	Q8IX03	1113 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	CCDC102A	Q96A19	550 aa		9.94	□□□□□ -0.82
CFAP74-208	ENST00000493316	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		9.94	□□□□□ -0.82

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