RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492979.2

SSC4D-202, Transcript of scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains, humanhuman

TSL 5

Gene SSC4D, Length 1,224 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4D-202ENST00000492979 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SSC4D-202ENST00000492979 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.22■■□□□ 1.47
SSC4D-202ENST00000492979 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.21■■□□□ 1.47
SSC4D-202ENST00000492979 JDP2Q8WYK2 163 aa24.21■■□□□ 1.47
SSC4D-202ENST00000492979 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.2■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 IGKV5-2P06315 115 aa24.2■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 APLP1P51693 650 aa24.2■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.19■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 FLIIQ13045 1269 aa24.19■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 GPC2Q8N158 579 aa24.19■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 SCN4AP35499 1836 aa24.19■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 PDE8AO60658 829 aa24.18■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 G2E3Q7L622 706 aa24.18■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 MPNDQ8N594 471 aa24.17■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
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SSC4D-202ENST00000492979 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
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SSC4D-202ENST00000492979 H7C1W4 665 aa24.15■■□□□ 1.46
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SSC4D-202ENST00000492979 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.15■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.14■■□□□ 1.46
SSC4D-202ENST00000492979 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.14■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 LINS1Q8NG48 757 aa24.14■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 COL4A5P29400 1685 aa24.14■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 RTL9Q8NET4 1388 aa24.14■■□□□ 1.45
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SSC4D-202ENST00000492979 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.13■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.13■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 E9PSI1 815 aa24.12■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.12■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 ZNF428Q96B54 188 aa24.12■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 PPIP5K2O43314 1243 aa24.11■■□□□ 1.45
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SSC4D-202ENST00000492979 GCKRQ14397 625 aa24.11■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 NIM1KQ8IY84 436 aa24.11■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.11■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 SLC51AQ86UW1 340 aa24.1■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 HACL1Q9UJ83 578 aa24.1■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 TAF1P21675 1872 aa24.09■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 CASP7P55210 303 aa24.09■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 CHADLQ6NUI6 762 aa24.09■■□□□ 1.45
SSC4D-202ENST00000492979 LDHDQ86WU2 507 aa24.09■■□□□ 1.45
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SSC4D-202ENST00000492979 CTSWP56202 376 aa24.08■■□□□ 1.45
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SSC4D-202ENST00000492979 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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SSC4D-202ENST00000492979 EPHX2P34913 555 aa24.06■■□□□ 1.44
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SSC4D-202ENST00000492979 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.06■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
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SSC4D-202ENST00000492979 CXCL9Q07325 125 aa24.05■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
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SSC4D-202ENST00000492979 POLLQ9UGP5 575 aa24.05■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.04■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 WASHC4Q2M389 1173 aa24.04■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 COL4A1P02462 1669 aa24.04■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 GPSM2P81274 684 aa24.03■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 TNIP1Q15025 636 aa24.03■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.03■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.03■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 MYH3P11055 1940 aa24.02■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 ALDH1L1O75891 902 aa24.02■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.02■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SSC4D-202ENST00000492979 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 POTEIP0CG38 1075 aa24.01■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 POTEJP0CG39 1038 aa24.01■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.01■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 PASKQ96RG2 1323 aa24.01■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 DPF2Q92785 391 aa24■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 GREM2Q9H772 168 aa24■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 XDHP47989 1333 aa24■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 YDJCA8MPS7 323 aa23.99■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.99■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.99■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 PTPRCP08575 1304 aa23.99■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 C6orf229H3BNL8 230 aa23.98■■□□□ 1.43
SSC4D-202ENST00000492979 ATP2B4P23634 1241 aa23.98■■□□□ 1.43
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