RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492885.1

STRBP-208, Transcript of spermatid perinuclear RNA binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene STRBP, Length 498 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRBP-208ENST00000492885 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 KCNA1Q09470 495 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 GPAT2Q6NUI2 795 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 ATCAYQ86WG3 371 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 HOMEZQ8IX15 550 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 EDEM1Q92611 657 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 RBSNQ9H1K0 784 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 OIP5O43482 229 aa5.84□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 SIN3BO75182 1162 aa5.84□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 USP5P45974 858 aa5.84□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.84□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.84□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 GSX2Q9BZM3 304 aa5.84□□□□□ -1.47
STRBP-208ENST00000492885 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 FAM177BA6PVY3 158 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 PHF20L1A8MW92 1017 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 OPLAHO14841 1288 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ICMTO60725 284 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 EHHADHQ08426 723 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 GRIN2CQ14957 1233 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 NLRP13Q86W25 1043 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ELOA3Q8NG57 546 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 WHAMMQ8TF30 809 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 SPACA7Q96KW9 195 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 LRRC4BQ9NT99 713 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.83□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ZBTB39O15060 712 aa5.82□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 GHRHP01286 108 aa5.82□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 EPXP11678 715 aa5.82□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ADH7P40394 386 aa5.82□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 POLIQ9UNA4 740 aa5.82□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 PDGFAP04085 211 aa5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 NEFLP07196 543 aa5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 PLAURQ03405 335 aa5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 PDE3BQ13370 1112 aa5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 CHSY3Q70JA7 882 aa5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 FAM35AQ86V20 835 aa5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 CPB1P15086 417 aa5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 KANK3Q6NY19 840 aa5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 BTBD6Q96KE9 485 aa5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ELP3Q9H9T3 547 aa5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ADAMTS8Q9UP79 889 aa5.8□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 MAP3K6O95382 1288 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 EGFRP00533 1210 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 IGHA1P01876 353 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 CES1P23141 567 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 HYAL2Q12891 473 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 FAM26DQ5JW98 314 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 NUDT8Q8WV74 236 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 TNFRSF25Q93038 417 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 PMEPA1Q969W9 287 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.79□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 M0R082 166 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 MMP20O60882 483 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 LILRB5O75023 590 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 PHACTR2O75167 634 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 MAPK1P28482 360 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 KLF15Q9UIH9 416 aa5.78□□□□□ -1.48
STRBP-208ENST00000492885 NPR3P17342 541 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms