RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492601.2

SGMS1-204, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-204ENST00000492601 TSPYL6Q8N831 410 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 COL4A1P02462 1669 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 MYD88Q99836 296 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 MRS2Q9HD23 443 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 PASKQ96RG2 1323 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 ANP32CO43423 234 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 WWC1Q8IX03 1113 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 VPS33BQ9H267 617 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 CREBZFQ9NS37 354 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-204ENST00000492601 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 EPS15P42566 896 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 SCNN1DP51172 638 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 CACNA1FO60840 1977 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 MYH3P11055 1940 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 CCDC27Q2M243 656 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 IFFO2Q5TF58 517 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 TMC4Q7Z404 712 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 CXCL9Q07325 125 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 CNTROBQ8N137 903 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 SPEF2Q9C093 1822 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 RAD17O75943 681 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 STK31Q9BXU1 1019 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-204ENST00000492601 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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SGMS1-204ENST00000492601 GPSM2P81274 684 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 KSR2Q6VAB6 950 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 CNTNAP1P78357 1384 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 IL16Q14005 1332 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 YDJCA8MPS7 323 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 C6orf229H3BNL8 230 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 RIMBP2O15034 1052 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 WASHC4Q2M389 1173 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 G2E3Q7L622 706 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 POLLQ9UGP5 575 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 PDE8AO60658 829 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 SCN9AQ15858 1988 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 SLC4A2P04920 1241 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 IGKV5-2P06315 115 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 TNIP1Q15025 636 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-204ENST00000492601 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.14■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 SHTN1A0MZ66 631 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 VEGFBP49765 207 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 DOK7Q18PE1 504 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 EYA3Q99504 573 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.13■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 TRAF5O00463 557 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 WDR63Q8IWG1 891 aa22.12■■□□□ 1.13
SGMS1-204ENST00000492601 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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