RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 LINS1Q8NG48 757 aa31.04■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 MYH3P11055 1940 aa31.03■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 C1QTNF8P60827 252 aa31.03■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 TAF1P21675 1872 aa31.02■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 KIF3CO14782 793 aa31.02■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 VPS33BQ9H267 617 aa31.02■■■□□ 2.56
EHD1-211ENST00000489379 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 IARSP41252 1262 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 CCDC152Q4G0S7 254 aa31.01■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 SUPT20HQ8NEM7 779 aa31■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 H7C1W4 665 aa30.99■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 GCKRQ14397 625 aa30.99■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.99■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.99■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 JDP2Q8WYK2 163 aa30.97■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.96■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 RPS8P62241 208 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.96■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 MPNDQ8N594 471 aa30.96■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
EHD1-211ENST00000489379 WDR90Q96KV7 1748 aa30.95■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 TOMM70O94826 608 aa30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 BEND3Q5T5X7 828 aa30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 RRAGCQ9HB90 399 aa30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 PTPRCP08575 1304 aa30.94■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 F6X3S4 739 aa30.93■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 CTSWP56202 376 aa30.93■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30.93■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 FZD9O00144 591 aa30.91■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 ALDH1L1O75891 902 aa30.91■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.91■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 RTL9Q8NET4 1388 aa30.91■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.9■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.9■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 CASP7P55210 303 aa30.89■■■□□ 2.54
EHD1-211ENST00000489379 PPIP5K2O43314 1243 aa30.88■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.88■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.88■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.88■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 SCN4AP35499 1836 aa30.87■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 NIM1KQ8IY84 436 aa30.87■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.86■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.85■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 SLC51AQ86UW1 340 aa30.85■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.85■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.84■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 AOC3Q16853 763 aa30.84■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 GPC2Q8N158 579 aa30.84■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 PODXL2Q9NZ53 605 aa30.84■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 GRM8O00222 908 aa30.83■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 CSF1RP07333 972 aa30.83■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
EHD1-211ENST00000489379 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.82■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 COL4A1P02462 1669 aa30.82■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 POTECB2RU33 542 aa30.82■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 FSTL1Q12841 308 aa30.82■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 EYA3Q99504 573 aa30.82■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 GREM2Q9H772 168 aa30.82■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 LTBP1Q14766 1721 aa30.81■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 DUOX1Q9NRD9 1551 aa30.81■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.81■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 COL4A5P29400 1685 aa30.81■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 GPSM2P81274 684 aa30.8■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 WASHC4Q2M389 1173 aa30.8■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.8■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 C6orf229H3BNL8 230 aa30.79■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.78■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.78■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 ITGA6P23229 1130 aa30.77■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.77■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 POLLQ9UGP5 575 aa30.77■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 XDHP47989 1333 aa30.76■■■□□ 2.52
EHD1-211ENST00000489379 SPEF2Q9C093 1822 aa30.76■■■□□ 2.51
EHD1-211ENST00000489379 GGA1Q9UJY5 639 aa30.76■■■□□ 2.51
EHD1-211ENST00000489379 UTYO14607 1347 aa30.75■■■□□ 2.51
EHD1-211ENST00000489379 HSPA6P17066 643 aa30.75■■■□□ 2.51
EHD1-211ENST00000489379 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
EHD1-211ENST00000489379 FOXO4P98177 505 aa30.75■■■□□ 2.51
EHD1-211ENST00000489379 HACL1Q9UJ83 578 aa30.75■■■□□ 2.51
EHD1-211ENST00000489379 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms