RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487621.5

SEMA3C-209, Transcript of semaphorin 3C, human

TSL 5

Gene SEMA3C, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3C-209	ENST00000487621	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	MPND	Q8N594	471 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	LTBP1	Q14766	1721 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	SCNN1D	P51172	638 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	COL4A1	P02462	1669 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	ANP32C	O43423	234 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	TMC4	Q7Z404	712 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	TAF1	P21675	1872 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	MYD88	Q99836	296 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	CREBZF	Q9NS37	354 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	IL16	Q14005	1332 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		32	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	EPS15	P42566	896 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	CXCL9	Q07325	125 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	IFFO2	Q5TF58	517 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SEMA3C-209	ENST00000487621	CNTROB	Q8N137	903 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	YDJC	A8MPS7	323 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	GPSM2	P81274	684 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	G2E3	Q7L622	706 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	STK31	Q9BXU1	1019 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	PDE8A	O60658	829 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	WDR63	Q8IWG1	891 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SEMA3C-209	ENST00000487621	RAD17	O75943	681 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	CNTNAP1	P78357	1384 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	WASHC4	Q2M389	1173 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	TNIP1	Q15025	636 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	VAMP4	O75379	141 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	C6orf229	H3BNL8	230 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
SEMA3C-209	ENST00000487621	FLII	Q13045	1269 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	CTSW	P56202	376 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	EYA3	Q99504	573 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621		H7C1W4	665 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	SHTN1	A0MZ66	631 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	RASSF10	A6NK89	507 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3C-209	ENST00000487621	PSMD14	O00487	310 aa		31.78	■■■□□ 2.68

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