RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.16□□□□□ -0.62
USP34-216ENST00000487547 SASH3O75995 380 aa11.15□□□□□ -0.62
USP34-216ENST00000487547 RARAP10276 462 aa11.15□□□□□ -0.62
USP34-216ENST00000487547 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
USP34-216ENST00000487547 NLRP13Q86W25 1043 aa11.15□□□□□ -0.62
USP34-216ENST00000487547 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.15□□□□□ -0.62
USP34-216ENST00000487547 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.15□□□□□ -0.62
USP34-216ENST00000487547 USP20Q9Y2K6 914 aa11.15□□□□□ -0.62
USP34-216ENST00000487547 H3BRB1 525 aa11.14□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 AMPD1P23109 780 aa11.14□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 MARSP56192 900 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 BTBD6Q96KE9 485 aa11.14□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 RASSF7Q02833 373 aa11.13□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 EHHADHQ08426 723 aa11.13□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 ATCAYQ86WG3 371 aa11.13□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 EDEM1Q92611 657 aa11.13□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 PIK3R2O00459 728 aa11.12□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 KANK3Q6NY19 840 aa11.12□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.12□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 MDFIQ99750 246 aa11.12□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 PDGFAP04085 211 aa11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 PSAPP07602 524 aa11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 ADH7P40394 386 aa11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 XKR5Q6UX68 686 aa11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 IGFLR1Q9H665 355 aa11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.1□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 PODNQ7Z5L7 613 aa11.1□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.1□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 ZFATQ9P243 1243 aa11.1□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.1□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 GDF11O95390 407 aa11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 SOX18P35713 384 aa11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 NRLP54845 237 aa11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 CHSY3Q70JA7 882 aa11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 CITED4Q96RK1 184 aa11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 POLIQ9UNA4 740 aa11.09□□□□□ -0.63
USP34-216ENST00000487547 NDUFB5O43674 189 aa11.08□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 FZD6O60353 706 aa11.08□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 IRS1P35568 1242 aa11.08□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 PLAURQ03405 335 aa11.08□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.08□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 C8orf34Q49A92 452 aa11.08□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.08□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 RRAGCQ9HB90 399 aa11.08□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 GPLD1P80108 840 aa11.07□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 PMEPA1Q969W9 287 aa11.07□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 ELP3Q9H9T3 547 aa11.07□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.07□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.07□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.06□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 MMP20O60882 483 aa11.06□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 ARHGAP4P98171 946 aa11.06□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 PDE3BQ13370 1112 aa11.06□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 ECM1Q16610 540 aa11.06□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.06□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.05□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 OR13H1Q8NG92 308 aa11.05□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.05□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.05□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 NEFLP07196 543 aa11.04□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 HOMEZQ8IX15 550 aa11.04□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 GJD3Q8N144 294 aa11.04□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 RBSNQ9H1K0 784 aa11.04□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 FAM35AQ86V20 835 aa11.03□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.03□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 FRRS1LQ9P0K9 344 aa11.03□□□□□ -0.64
USP34-216ENST00000487547 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.02□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 SIK1P57059 783 aa11.02□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 HYAL2Q12891 473 aa11.02□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.02□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.01□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 DGKGP49619 791 aa11.01□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 MICALL1Q8N3F8 863 aa11.01□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 SPACA7Q96KW9 195 aa11.01□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.01□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 M0R082 166 aa11□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 GNB5O14775 395 aa11□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 LILRB5O75023 590 aa11□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 GHRHP01286 108 aa11□□□□□ -0.65
USP34-216ENST00000487547 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms