RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486076.5

GABPB2-205, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB2, Length 833 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-205ENST00000486076 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.52■□□□□ 0.88
GABPB2-205ENST00000486076 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.52■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 GCKRQ14397 625 aa20.51■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.51■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.51■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.51■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 H7C1W4 665 aa20.5■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.5■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 SP8Q8IXZ3 490 aa20.5■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.5■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.49■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 BEND3Q5T5X7 828 aa20.49■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 MYH3P11055 1940 aa20.49■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 GLTPD2A6NH11 291 aa20.48■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 KIF3CO14782 793 aa20.48■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 TMC4Q7Z404 712 aa20.48■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.48■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 CTSWP56202 376 aa20.47■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.47■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.47■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.47■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 COL4A1P02462 1669 aa20.46■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 CASP7P55210 303 aa20.46■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.46■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 MPNDQ8N594 471 aa20.46■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.46■□□□□ 0.87
GABPB2-205ENST00000486076 C1QTNF8P60827 252 aa20.45■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 RRAGCQ9HB90 399 aa20.45■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 PTPRCP08575 1304 aa20.45■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.44■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.44■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.44■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.44■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 ALDH1L1O75891 902 aa20.43■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 JDP2Q8WYK2 163 aa20.43■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.43■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.43■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 PPIP5K2O43314 1243 aa20.42■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.42■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 GREM2Q9H772 168 aa20.42■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 COL4A5P29400 1685 aa20.42■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 GRM8O00222 908 aa20.41■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 AOC3Q16853 763 aa20.41■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 VPS33BQ9H267 617 aa20.41■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.41■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 FZD9O00144 591 aa20.4■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 GPSM2P81274 684 aa20.4■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 NIM1KQ8IY84 436 aa20.4■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 RTL9Q8NET4 1388 aa20.4■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 WDR90Q96KV7 1748 aa20.4■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GABPB2-205ENST00000486076 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.38■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 CSF1RP07333 972 aa20.38■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 FAM161AQ3B820 660 aa20.38■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 SPEF2Q9C093 1822 aa20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 POTECB2RU33 542 aa20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 C6orf229H3BNL8 230 aa20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 TOMM70O94826 608 aa20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 ITGA6P23229 1130 aa20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 FOXO4P98177 505 aa20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.36■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 POLLQ9UGP5 575 aa20.36■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 LTBP1Q14766 1721 aa20.36■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 WASHC4Q2M389 1173 aa20.35■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.35■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.35■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.35■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.35■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 UFL1O94874 794 aa20.34■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.34■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 GPC2Q8N158 579 aa20.34■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 SUCLG2Q96I99 432 aa20.34■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 EYA3Q99504 573 aa20.34■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 GGA1Q9UJY5 639 aa20.34■□□□□ 0.85
GABPB2-205ENST00000486076 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms