RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 WDR63Q8IWG1 891 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 GPC2Q8N158 579 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 MPNDQ8N594 471 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 CHADLQ6NUI6 762 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 G2E3Q7L622 706 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 NIM1KQ8IY84 436 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 HACL1Q9UJ83 578 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.15■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 SLC4A2P04920 1241 aa24.15■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 KSR2Q6VAB6 950 aa24.15■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.15■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.15■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 EPHX2P34913 555 aa24.14■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 TMC4Q7Z404 712 aa24.13■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 VPS33BQ9H267 617 aa24.13■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 TAF1P21675 1872 aa24.13■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 IGKV5-2P06315 115 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 LDHDQ86WU2 507 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 KLRG1Q96E93 195 aa24.11■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.11■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 COL4A1P02462 1669 aa24.11■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 SCN4AP35499 1836 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 VAMP4O75379 141 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 PDE8AO60658 829 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 SCNN1DP51172 638 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 GPSM2P81274 684 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 CXCL9Q07325 125 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 FLIIQ13045 1269 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
UPP1-211ENST00000482015 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 EPS15P42566 896 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 POLLQ9UGP5 575 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 C6orf229H3BNL8 230 aa24.05■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 RIMBP2O15034 1052 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 RAD17O75943 681 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 WASHC4Q2M389 1173 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 PASKQ96RG2 1323 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 LTBP1Q14766 1721 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 YDJCA8MPS7 323 aa24.03■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.03■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 CTSWP56202 376 aa24.02■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 CNTROBQ8N137 903 aa24.02■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 JMYQ8N9B5 988 aa24.02■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.02■■□□□ 1.44
UPP1-211ENST00000482015 H7C1W4 665 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 CREBZFQ9NS37 354 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 GCKRQ14397 625 aa24■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 TNIP1Q15025 636 aa24■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 DOK7Q18PE1 504 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 EYA3Q99504 573 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 GREM2Q9H772 168 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 ZNF521Q96K83 1311 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 F6X3S4 739 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 UFL1O94874 794 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-211ENST00000482015 LINS1Q8NG48 757 aa23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms